Introducción a la Morfometría Geométrica 3D.
Aplicación en Paleontología
La morfometría geométrica es el análisis estadístico de la forma, basado en
las coordenadas cartesianas de puntos de referencia (landmarks), los cuales tienen un significado biológico y
localizaciones homólogas entre los objetos de estudio. Esta técnica permite la
cuantificación de las características geométricas de estructuras anatómicas,
así como su relación espacial.
La frase “Forma es toda la información geométrica que resulta de retirar
los efectos de la posición, escala y rotación de un objeto” (Kendall, 1977)
resume el principio básico de la morfometría geométrica: analizar la forma de
manera aislada, sin tener en cuenta todos aquellos aspectos que no definen la
pura geometría del objeto. Esta información bruta sobre la forma se obtiene
gracias a la superposición Procrustes de todas las configuraciones de landmarks que se han estudiado, lo que
resulta en unas nuevas coordenadas (Procrustes shape coordinates) que se pueden analizar estadísticamente. Pero
antes de esto, se debe llevar a cabo la obtención de los datos primarios, las
coordenadas de los landmarks que
queremos estudiar. Por ello, en este workshop
aprenderemos a:
-
Desarrollar
una plantilla de digitalización (template),
en la que se incluirán los landmarks
que queremos estudiar en nuestra estructura.
-
Obtener los
datos primarios (digitalización de las estructuras), con lo que tendremos las
coordenadas cartesianas de los landmarks
de cada individuo.
-
Realizar la
superposición Procrustes para obtener la información bruta sobre la forma.
-
Analizar
estadísticamente esta información geométrica resultante de la superposición
Procrustes, así como diferentes ejemplos de utilización de la morfometría
geométrica.
Dado que este workshop se enmarca
dentro del Encuentro de Jóvenes Investigadores en Paleontología (EJIP), durante
el mismo, se utilizarán estructuras e individuos, se realizarán análisis y se
mostrarán ejemplos que guardarán relación con el área de estudio de la
Paleontología.
Material necesario para realizar el workshop con fluidez:
-
Portátil personal
y pen-drive.
-
Programa Morphologika2 v2.5 instalado. Se puede
descargar de manera gratuita en el siguiente enlace: https://sites.google.com/site/hymsfme/downloadmorphologica
-
Programa Viewbox 4.0.1.7 instalado. Se puede
descargar de manera gratuita en el siguiente enlace: http://www.dhal.com/viewbox_downloads.htm
Bibliografía que sería interesante ojear antes del workshop:
-
Toro
Ibacache, M. V., Manriquez Soto, G., & Suazo Galdames, I. (2010).
Morfometría geométrica y el estudio de las formas biológicas: de la morfología
descriptiva a la morfología cuantitativa. International Journal of Morphology,
28(4), 977-990.
-
Zelditch, M. L., Swiderski, D.
L., & Sheets, H. D. (2012). Geometric morphometrics for biologists: a
primer. Academic Press.
-
Bookstein, F. L. (1997).
Morphometric tools for landmark data: geometry and biology. Cambridge University Press.
Contacto: Este workshop será impartido por Carlos A.
Palancar (palancar.carlos@gmail.com)
y otr@s miembr@s del Laboratorio de Morfología Virtual (ViMoLab, MNCN-CSIC).
Número de plazas: Mínimo 5 y máximo 20
Cheating in TNT: Una Chuleta para no Cagarla (Mucho)
con la Cladística en Paleontología
Estas a preparar tu primer artículo.
Has leído toda la literatura. Has visto todas las colecciones relevantes. Has
construido tu propia matriz de datos.
Vas a revolucionar el conocimiento sobre la filogenia de tu grupo. Solo queda abrir TNT y…
ERROR (From command line) Found alien symbol for taxon 0… Continue parsing?
En este workshop aprenderás a perderle el miedo a TNT, el programa de
filogenia cuantitativa usando parsimonia más utilizado en la literatura
científica. Trabajaremos como enfrentarte a un nuevo análisis, conceptos
básicos sobre la construcción de matrices, algoritmos de búsqueda de árboles,
interpretación y presentación de resultados y, sobre todo, un pequeño manual de
buenas prácticas y errores comunes a evitar cuando se comienza a trabajar con
análisis cladísticos.
El curso es de tipo introductorio, pero requiere unos conocimientos mínimos de filogenia y cladística basada en
parsimonia.
Material necesario para realizar el workshop con fluidez:
Es necesario traer un ordenador portátil, preferiblemente con Windows de 64
bits, ya que las versiones Linux e IOs no tienen interfaz gráfica.
Contacto: Miguel Moreno Azanza mmazanza@fct.unl.pt
Número de plazas:
Mínimo 5 y máximo 20
La preparación paleontológica: primeros pasos para la conservación
Este workshop esta dividido en dos partes.
INTRODUCCION TEORICA
En primer lugar se impartirá una conferencia a cargo de Fatima Marcos
titulada: La conservación- restauración
de macrovertebrados fósiles ... una asignatura pendiente
PRACTICA
A continuacion se habra tres horas de prácticas donde se aprenderán las
tecnicas básicas de empapelado, engasado, desengasado, desempapelado y hacer paraloid. Estas acciones se
realizarán sobre unas probetas de escayola.
No se precisan de
conocimientos previos
El material sera suministrado en
el propio workshop.
Contacto: Fátima Marcos (famarcos@ucm.es)
Número de plazas:
Mínimo 5 y máximo 20
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